Ez a felismerő rendszer egy különlegesen precíz, érzékeny és fontos “műszer”, hiszen pontosan tisztában kell lennie azzal, hogy melyek az idegen és melyek saját sejtek, illetve a nem saját sejteket is be kell tudnia sorolni “kívánatos” és “nemkívánatos” kategóriába. Léteznek ugyanis a szervezetünkben olyan szervezetünkön kívüli sejtek, amelyeknek védettséget kell élvezni egyes speciális folyamatok (például a bélcsatornában élő, az emésztés során közreműködő hasznos baktériumok, vagy éppen a fajfenntartás érdekében maga a magzat, mint “idegen” sejt) gond nélküli végbemenetele érdekében.

Ha ebben az összetett és érzékeny szerkezetben hiba lép fel, akkor annak két következménye lehet.

Az egyik immunrendszert érintő probléma a védekezőképesség meggyengülése, más néven immunhiány, a másik a saját vagy hasznos idegen sejtek felismerésének zavara, vagyis az autoimmun betegség.

Mindezek alapján már könnyebb megérteni, hogy abban az esetben amikor saját szervezetünk fordul önmagunk ellen, és a saját sejtjeinket vagy szerveinket kezdi támadni, teljesen fölösleges az immunerősítés. Sőt! Bizonyos esetekben akár ártalmas is lehet.